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La Taxonomía y Ecología de Líquenes es una línea de investigación que se viene desarrollando en el laboratorio de Biología Vegetal de la Facultad de Ciencias Biológicas. Los estudios se están llevando a cabo en los bosques templados, bosques mesófilos de montaña, selvas tropicales y zonas áridas de los estados de Estado de México, Guerrero, Morelos, Oaxaca, Puebla, Tlaxcala y Veracruz. El objetivo de dichos estudios es tratar de explicar el impacto de la estructura forestal en las comunidades liquénicas, a partir del análisis de algunos parámetros ecológicos.
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