
Cargo: Responsable.
Impacto de la estructura forestal en los macrolíquenes cortícolas del Corredor Biológico Chichinautzin, Morelos.

Cargo: Responsable.
Estudio de la flora liquénica de la región de Tehuacán-Cuicatlán y del bosque mesófilo de montaña de Cuetzalán, Puebla.

Cargo: Responsable.
Composición de las comunidades liquénicas del Parque Nacional La Malinche, Puebla-Tlaxcala.

Cargo: Responsable.
Estudio de la flora liquénica en remanentes de bosque mesófilo de la sierra nororiental y de selva baja caducifolia de San Pedro Atlixco, Puebla. Colaboradora: M. en C. Lucero M. Cuautle García. Facultad de Ciencias Biológicas-BUAP.

Colaboración Interna.
Estructura de la comunidad de líquenes foliícolas asociados a Stenanona flagelliflora (Annonaceae). Investigador responsable: Dra. Dulce Ma. Figueroa Castro. Facultad de Ciencias Biológicas-BUAP.

Colaboración Externa.
Inventario y base de datos de los líquenes de la selva seca de Jalisco. Investigador responsable: Dra. Ma. de los Ángeles Herrera-Campos. Instituto de Biología-UNAM. CONABIO. (2012)

Colaboración Externa.
Towards an Inventory of the Lichens of Mexico with an Emphasis on the Parmeliaceae, Investigador responsable: Dr. Thomas H. Nash III - Arizona State University. US National Science Foundation (2006-2010).

Colaboración Externa.
Análisis de la comunidad liquénica en un remanente de bosque mesófilo de montaña en La Cortadura, Coatepec, Veracruz. Colaboradores: Dr. Gonzalo Castillo-Campos, INECOL, A.C., Xalapa, Veracruz.

2017
Lücking, R., Dal Forno, M., Moncada, B., Coca, L.F., Vargas-Mendoza. L.Y., Aptroot, A., Arias, L.J., Besal, B., Bungartz, F., Cabrera-Amaya, D.M., Cáceres, M.E.S., Chaves, J.L., Eliasaro, S., Gutiérrez, M.C., Hernández Marin, J.E., Herrera-Campos, M.A., Holgado-Rojas, M.E., Jonitz, H., Kukwa, M., Lucheta, F., Madriñán, S., Marcelli, M.P., de Azevedo Martins, S.M., Mercado-Díaz, J.A., Molina, J.A., Morales, E.A., Nelson, P.R., Nugra, F., Ortega, F., Paredes, T., Patiño, A.L., Peláez-Pulido, R.N., Pérez Pérez, R.E., Perlmutter, G.B., Rivas-Plata, E., Robayo, J., Rodríguez, C., Simijaca, D.F., Soto-Medina, E., Spielmann, A.A., Suárez-Corredor, A., Torres, J-M., Vargas, C.A., Yánez-Ayabaca, A., Weerakoon, G., Wilk, K., Pacheco, M.C., Diazgranados, M., Brokamp, G., Borsch, T., Gillevet, P.M., Sikaroodi, M. & J. D. Lawrey. 2016. Turbo-taxonomy to assemble a megadiverse lichen genus: seventy new species of Cora (Basidiomycota: Agaricales: Hygrophoraceae), honouring David Leslie Hawksworth’s seventieth birthday. Fungal Diversity. 84:139–207 DOI 10.1007/s13225-016-0374-9 Octubre: 1-69. DOI 10.1007/s13225-016-0374-9

2016
Córdova-Chávez, O., Castillo-Campos, G., Pérez-Pérez, R.E., García Franco, J.G. & M.E.S. Cáceres. 2016 - Alpha diversity of lichens associated with Quercus laurina in a Mountain Cloud Forest at Cofre de Perote eastern slope (La Cortadura), Veracruz, Mexico. Cryptogamie, Mycologie 37(2):1-12. doi/10.7872/crym/v37.iss2.2016.193

2015
Pérez-Pérez, R. E. & G. Guzmán. 2015 - Parmotrema species in a cloud forest region converted to an urban zone in Xalapa, Veracruz, Mexico. Revista BOSQUE. 36(3): 357-362. DOI: 10.4067/S0717-92002015000300003

2015
Pérez-Pérez, R. E., Castillo-Campos, G. & M.E.S. Cáceres. 2015 - Diversity of corticolous lichens in cloud forest remnants in La Cortadura, Coatepec, Veracruz, México in relation to phorophytes and habitat fragmentation. Cryptogamie, Mycologie 36(1):79-92. http://dx.doi.org/10.7872/crym.v36.iss1.2015.79

2014
Córdova-Chávez, O., Aptroot, A., Castillo-Campos, G., Cáceres, M.E.S. & R.E. Pérez-Pérez. 2014. Three new lichen species from cloud forest in Veracruz, Mexico. Cryptogamie, Mycologie 35 (2): 157-162. doi/10.7872/crym.v35.iss2.2014.157

2014
Herrera-Campos, M.A., Lücking, R., Pérez-Pérez, R.E., Miranda-González, R., Sánchez, N., Barcenas-Peña, A., Carrizosa, A., Zambrano, A., Ryan, C. B. & T. H. Nash III. 2014. Biodiversidad de líquenes en México. Revista Mexicana de Biodiversidad 85: 82-99. DOI: 10.7550/rmb.37003

2014
Aptroot, A., Mercado-Díaz, J. A., Bárcenas-Peña, A., Cáceres, M.E.S., Coca, L.F., Dal-Forno, M., Cunha Feuerstein, S., Herrera-Campos, M.A., Joshi, S., Kirika, P.M., Kraichak, E., Lumbsch, R.H., Miranda-González, R., Moncada, B., Nelsen, M.P., Pérez Pérez, R.E., Scharnagl, K., Soto Medina, E., Yánez-Ayabaca, A. y R. Lücking. 2014. Rapid assessment of the diversity of “vehiculicolous” lichens on a thirty-year-old Ford Bronco truck in central Puerto Rico. FUNGI. 7:2-3

2011
Pérez-Pérez, R.E., Egan, S., Nash III. T.H. & J.A. Elix. 2011. Parmotrema mirandum (Hale) Hale: A Revised Chemistry and New Records from Guerrero and Morelos, Mexico. The Bryologist 114(3): 474–476. DOI: 10.1639.0007-2745-114.3.474

2011
Pérez-Pérez, R.E., Quiroz-Castelán, H., Herrera-Campos, M.A. & R. García Barrios. 2011. Scale-dependent effects of management on the richness and composition of corticolous macrolichens in pine-oak forest of Sierra de Juárez, Oaxaca, Mexico. Bibliotheca Lichenologica106: 247-262.

2010
Pérez-Pérez, R.E. & T.H. Nash III. 2010. The genus Canoparmelia in Mexico. Bibliotheca Lichenologica 105: 225-238.

2010
Esslinger, T. L. and R. E. Pérez-Pérez. 2010. The lichen genus Melanohalea in Mexico, including a new endemic species. Bibliotheca Lichenologica 105: 239-245.

2008
Pérez-Pérez R. E., Miramontes-Rojas, N., Aguilar-Rosales, J. y H. Quiroz-Castelán. 2008. Macrolíquenes cortícolas en coníferas del Parque Nacional Lagunas de Zempoala. Revista Acta Universitaria. Universidad de Guanajuato. 18(2): 33-39. DOI: http://dx.doi.org/10.15174/au.2008.147

2005
Bjerke, W. J., Sipman, H. & R.E. Pérez-Pérez. 2005. Menegazzia neotropica (Parmeliaceae, lichenized Ascomycota) new to Costa Rica and Mexico. MYCOTAXON 91: 419-422.
